В качестве прототипа главного героя аниме "Манускрипт ниндзя" Дзюбэя Кибагами был выбран настоящий исторический персонаж, - Яго Дзюбэй, героические поступки которого стали основой для многочисленных народных сказаний и легенд.
Впрочем, создателям аниме удалось на основе героя японского эпоса представить в своей картине по-настоящему уникальную личность, которая очень мало общего с прототипом, в частности, мастер меча из «Манускрипта ниндзя» гораздо моложе и не имеет серьезных физических увечий в отличие от исторического героя. Вообще, Дзюбэй Кибагами – сборный образ, отражающий принципиально новое видение воина, не имеющего прошлого и не задумывающегося о будущем.
Помимо поразительных способностей в области владения кэндзюцу, Дзюбэй также владел таинственной техникой управления оружием на расстоянии, - иногда ему удается поразить противника с помощью особой силовой волны.
Схватка Дзюбэя с демоном Тэссэем (демон с каменной кожей) показала, что он хорошо держит удар и обладает чувством юмора.
Основное время ронин проводит в путешествия, периодически выполняя различную работу, начиная от охраны, заканчивая помощью по дому.
В принципе, он не стремится к славе, а иногда откровенно отказывается от благородной миссии спасения мира, что говорит о его стремлении к спокойной жизни. В месте с тем, он чрезвычайно благороден и не может оставить человека в беде, - так, он спасает представительницу клана Кога от атаки демона и невольно становится втянутым в борьбу за власть в Японии.
Поскольку решение бороться с демонами было принято во многом из-за умелого шантажа со стороны Дакуана, действующего по приказу правительства (Дзюбэй был отравлен и только Дакуан знал противоядие), Дзюбэй очень неохотно включился в борьбу, однако в конечном итоге победил всех демонов во главе с Геммой. В самом конце фильма становится известно, что у главного героя были также личные счеты с предводителем демонов.